中国海洋大学基于Docker的高性能计算平台
中国海洋大学始创于1924年,是一所海洋和水产学科特色显著、学科门类齐全的教育部直属重点综合性大学,是国家“985工程”和“211工程”重点建设的高校,2017年9月入选国家“世界一流大学建设高校”(A类)。
作为校内跨院组合机构和海洋生物学国家重点学科、生物学一级学科博士点的构成之一,海洋生物多样性与进化研究所(下面简称IEMB)于2010年2月成立,所内各团队主要聚焦于海洋重要模式生物、重要功能类群的多样性、发育与进化等基础理论领域,并在海洋纤毛虫学、模式动物的发育与进化、海洋微生物多样性与系统学等领域取得了国内外公认的成就。
基于中国海洋大学“十三五”大水产数据平台的规划和现有研究工作的不断深化和展开。IEMB关于基因研究的项目, 出现了爆炸性增长,老师和学生面对的海量生物学数据,与基因相关的生物学数据增长幅度越来越大,数据翻番的时间不断加快。数据积累已远远超出了实验室的分析能力,而传统的计算方法也遇到了挑战。要解决这样的问题就必须使用新的技术、工具发展新的分析理论、方法,这就需依靠高性能计算机集群来完成信息处理工作。基于此,IEMB准备构建大型生物信息高性能计算中心来解决数据处理、交换和存储等科研瓶颈。
东方超算针对IEMB的迫切需求现状,和主管该项目的老师以及IEMB的各个科研团队教授和师生经过多次技术交流和项目沟通,最终根据用户的需求和项目建议,实现了一个基于容器引擎Docker技术为支撑的用于支持研究所日常教学、实验和科研的高性能计算平台,该平台依托于东方超算相关软件实现,为IEMB的师生提供各种稳定的、轻量级、高度可定制的系统应用服务,从而帮助IEMB实现快速高效的计算分析和数据处理等科研任务,获得了IEMB的一致好评。
本次项目采用私有容器仓库+容器管理的方式,实现容器分发与调用,容器通过调度系统按需调用硬件资源启动,实现弹性计算。并提供业界最佳的使用体验,针对海洋大学需求定制“一站式”登录门户,支持“Web Desktop”。